認定好處之一：依法享受稅收優惠
 依據《中華人民共和國企業所得稅法》及其《實施條例》、《中華人民共和國稅收征收管理法》及其《實施細則》規定，國家需要重點扶持的高新技術企業減按15％征收企業所得稅。同時，依據財稅字[1999)273號文件規定，高新技術企業進口所需的自用設備及按照合同隨設備進口的技術及配套件、備件，除按照國發[[1997]37號文件規定《國內投資項目不予免稅的進口商品目錄》所列商品外，免征關稅；引進《國家重點支持的高新技術領域》所列的先進技術，按合同規定向境外支付的軟件費(包括向境外賣方支付的專利費、商標費以及專有技術、計算機軟件和資料等費用)，免征關稅等。
認定好處之二：優先獲得政府支持
 國務院關于印發實施《國家中長期科學和技術發展規劃綱要(2006～2020年)》若干配套政策的通知(國發[2006]6號)中有關金融支持、科技保險、政府采購、外匯管理等方面，對高新技術及高新技術企業制定了若干優先權政策；四川省人民政府關于印發加強自主創新促進高新技術產業發展若干政策的通知(川府發[2007]23號)，對高新技術產業發展制定了若干扶持政策。這次按照條件，通過認定的高新技術企業，都可以享受這些政策。同時，認定了的高新技術企業，還可享受科技保險的保費補貼；還可通過創業投資融資。只有高新技術企業，科技保險費用才能歸集到技術研發費，才能得到各級科技資金的補貼；創業投資只有投資于未上市的高新技術企業，滿2年以上的，才可以按照其投資額的70％，在股權持有滿2年的當年，抵扣該創業投資企業的應納稅所得額。
認定好處之三：引導企業形成核心競爭力
企業的核心競爭力主要表現在企業擁有的專利的質量和數量上。由于世界經濟一體化的到來，發達國家利用專利遏制中國企業的發展手法嫻熟，很多企業吃盡了苦頭。高新技術企業認定，把企業擁有專利數特別是發明專利數作為一票否決指標，逼著企業去創造、申請、保護專利，進而形成核心競爭力。這是在當前國人普遍知識產權意識缺乏的情況下，政府沒辦法而權宜之。有企業說，專利要公開，別人更好仿制，我用企業秘密保護、效果更好。這要區別對待。若用企業秘密保護，企業必須要有非常高超的技巧，如可口可樂的配方，幾百年就通過商業秘密保護，無人知曉，但我們眾多的企業技術秘密，由于企業技術人員特別是高層管理人員跳槽而導致泄密，維權取證很困難，特別是要認定為技術秘密更困難。如果申請了專利，在公證員的配合下，將產品買回來，或將技術工藝用攝像機照回來，一解剖是否在專利保護范圍內就可以了，維權容易得多。當然，申請專利能否維權，與專利代理人申請專利時提出的權利要求有很大關系，因此，要請熟悉業務的專利代理人代理申請專利，企業形成的核心競爭力才能得到有效保護。企業要善于運用專利和技術秘密兩種手段，來保護自己、發展自己。
認定好處之四：引導企業規范內部管理
 這次高新技術企業認定，增加了有資質的會計師事務所和稅務師事務所幫助企業歸集資料，對企業規范內部管理有十分積極的促進作用。可以這樣說，企業通過高新技術企業認定，現代企業管理制度將會得到進一步落實，企業的管理水平將有明顯提升，企業的效率將會顯著提高，真正體現高新技術蓬勃發展的生機和活力。